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“稳定性同位素示踪DNA/RNA-SIP与全基因组关联分析技术研讨会暨培训班”在南京土壤所举行

发布时间:2016-06-22 点击次数:929

  5月29日至6月2日,“稳定性同位素示踪DNA/RNA-SIP 与全基因组关联分析技术研讨会暨培训班”在南京土壤研究所举行。来自国内18所高校和研究机构的83位青年科研人员参加了此?#20301;?#35758;。
  在理论培训会上,James Cole教授以Challenges in Microbiome Analysis为题,系统回顾了组学的发展历史,剖析了组学时代大数据分析面临的技术?#35757;?#19982;关键瓶颈,从基因组和宏基因组/转录组的角度审视了土壤微生物/环境微生物的在数据分析和挖掘方面的核心问题及应对策略;南京土壤所贾仲君研究员系统介绍了稳定性同位素示踪核酸 DNA/RNA-SIP技术及其应用,以13C-DNA宏基因组为例,分析了先进高通量测序技术如PacBio在未来土壤微生物学及相关研究中的应?#20204;?#26223;;南京土壤所蔡元峰博士以水稻土转录组数据为例,重点介绍了转录组水平的群落关联分析技术、MG-RAST的实践指南及应用优势。
  在操作实践课?#35752;校?#23494;西根州立大学核糖体RNA数据库项目(Ribosomal Database Project,简称RDP)生物信息专家王琼和柴本立研究员就纯菌基因组拼接理论与操作、宏基因及功能基因拼接理论与操作、标靶基因分析和宏转录组四个方面做了详细的讲解。结合生物学信息研讨和培训,贾仲君及其课题组成员为青年科研人员进行了DNA-SIP技术?#21335;?#22330;操作示范,强化了学员对DNA/RNA-SIP技术的理论认识和实践体验。
  此次研讨会由中国土壤学会青年工作者委员会、中国微生物学会环境微生物专业委员会、江苏省土壤学会土壤微生物专业委员会主办,土壤与农业可?#20013;?#21457;展国家重点实验室和美国密西根州立大学微生物生态?#34892;?#32852;合承办。活动得到了国内同行的热烈反响,促进了土壤微生物组学技术在相关领域的应用,提升了非生物信息专 业研究生和青年科研人员对个体微生物组学分析、13C-DNA/RNA 示踪、复杂微生物组的挖掘能力,有利于国内相关领域的青年科研人员对先进技术的认识,加强了不同学科之间青年科研人员?#21335;?#20114;交流。

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